O Conselho de Representante de Base do Sinasefe-IFSul foi criado regimentalmente em 2013, como órgão deliberativo de instância imediatamente inferior à Assembleia Geral, é constituído de delegados(as) eleitos(as) na base, por local de trabalho.

Ao longo dos anos, o conselho passou por diversas reestruturações, que aumentaram a autonomia dos conselheiros, estabelecendo regras para a realização de assembleias locais de base, destinando recursos próprios para os núcleos e garantindo a representação da base em eventos e congressos do Sinasefe.

Atualmente, o Conselho é composto por 15 núcleos de base, um representando cada campus do IFSul mais a reitoria, compostos por três representantes – sendo um(a) presidente, um(a) secretário(a) e um(a) tesoureiro(a) – e seus suplentes.